Р24001: Заявление о внесении изменений в сведения об индивидуальном предпринимателе, содержащиеся в Едином государственном реестре индивидуальных предпринимателей | ФНС России

Р24001: Заявление о внесении изменений в сведения об индивидуальном предпринимателе, содержащиеся в Едином государственном реестре индивидуальных предпринимателей | ФНС России

Заполнение формы Р24001 — постраничный пример 2022 года

• 11 октября 2021
• Просмотров:
• Автор статьи: tinkoff

Когда у индивидуального предпринимателя меняются данные, указанные в ЕГРИП, об этом должна узнать налоговая. ФНС обновит сведения в реестре до состояния актуальных. В форме не нужно заполнять все листы, понадобятся лишь те, которые соответствуют изменениям ИП. Важно учитывать требования к оформлению бланка, иначе заявление не примут и информация не обновится.

Содержание:

1. Титульный лист — Страница 001
2. Изменение личных сведений ИП — Лист А
3. Смена документа, удостоверяющего личность, — Лист Б
4. Изменение адреса места жительства в РФ — Лист В
5. Изменение ВНЖ или РВП — Лист Г
6. Смена кодов ОКВЭД — Лист Д
7. Информация о заявителе — Лист Е
8. Общие требования к заполнению формы Р24001

Автоматически сформировать заявление Р24001 для изменений ИП и подать онлайн

Форма заявления Р24001 — Создать заявление

• Сформировать заявление автоматически и подать онлайн Укажите свои данные в форме, скачайте уже заполненное заявление Р24001 и все другие документы для смены данных в ЕГРИП. Подайте документы онлайн с нашим сервисом или самостоятельно. Сформировать заявление
• Скачать шаблон Р24001 для заполнения вручную на компьютере XLS, 384 KB
• Скачать бланк Р24001 для печати и заполнения от руки PDF, 1,2 МB

1. Титульный лист — Страница 001

Титульный лист нужно подготовить всем индивидуальным предпринимателям, которые в 2022 году подают в налоговую форму Р24001. На странице 001 нужно внести сведения об ИП и причину подачи заявления.

Страница 001

В пункте 1 на странице 001 укажите данные ИП: его ОГРНИП и ФИО, согласно информации, которая содержится в ЕГРИП.

Если заявление подается из-за смены ФИО, на первой странице надо вписать прежние ФИО, которые фигурируют в выписке из ЕГРИП. Для новых ФИО предназначен лист А.

В пункте 2 нужно вписать код причины:

• 1 — подача заявления в связи с изменением сведений об ИП,
• 2 — в связи с исправлением ошибок.

В пункте 3 ИП может указать, изменить или исключить адрес своей электронной почты. Этот адрес будет находиться в публичном доступе и виден в выписке из ЕГРИП.

Адрес электронной почты в пункте 3 титульного листа — это не тот же адрес, что вы указываете на листе Е. Второй адрес – контактный, виден только ФНС и будет использован для отправки вам документов. Адреса могут совпадать.

2. Изменение личных сведений ИП — Лист А

Лист А предназначен для заполнения при смене фамилии, имени или отчества, пола, данных о рождении и гражданства.

Лист А

В пункт 1.1 впишите ФИО русскими буквами, а в пункт 1. 2 — латиницей. Указывайте эти сведения по документу, удостоверяющему личность, или его нотариально заверенному переводу.

В пункте 2 выберите нужное значение при изменении пола: «1» — мужской пол, «2» — женский пол.

Пункт 3 заполняется при изменении сведений о рождении: дате и месте рождения. Второе заполняется только гражданами России.

В пункте 4 проставьте цифровой код об изменении гражданства:

• «1» — гражданин РФ,
• «2» — иностранный гражданин,
• «3» — лицо без гражданства.

Для значения «2» внесите код страны гражданства ИП-иностранца по Общероссийскому классификатору стран мира.

Подробнее: Когда нужно сообщать в налоговую о смене фамилии ИП

3. Смена документа, удостоверяющего личность, — Лист Б

На листе Б указываются сведения о новом документе, удостоверяющем личность.

Лист Б

Внесите код вида документа. Так, «21» — это код паспорта гражданина Российской Федерации.

Серию и номер документа, дату выдачи, кем выдан документ, код подразделения вносите с теми же сокращениями, как и в документе.

При заполнении листа Б иностранцем некоторые поля могут остаться пустыми.

Нужна помощь в заполнении формы Р24001?

Введите свои данные, далее наш онлайн-сервис заполнит форму № Р24001 с учетом требований закона и ФНС. Это займёт не больше 15 минут. Готовое заявление можно скачать и распечатать с инструкцией по подаче. А можно воспользоваться удобным предложением и направить документы онлайн с нашим сервисом!

Онлайн-подачаСкачать документы

Онлайн-подачаСкачать документы

4. Изменение адреса места жительства в РФ — Лист В

На листе В напишите измененный адрес места жительства в России.

Лист В

В 2022 году, в связи с изменением формы № Р24001, добавлены поля для более удобного написания адреса индивидуального предпринимателя. Индекс теперь писать не нужно.

Адресные элементы следует вносить по данным Государственного адресного реестра.

Адрес вносится так:

• Субъект РФ. Впишите двухзначный код.
• Муниципальное образование. Это муниципальный район, городской округ, сельское поселение и др. Укажите цифровое значение его вида и название.
• Населенный пункт. Город, деревня, село и др. Указываются вид и наименование.
• Далее внесите элементы:
  • Планировочной структуры. Квартал, микрорайон, зона и др.,
  • Улично-дорожной сети. Это улица, проезд, проспект, бульвар и др.,
  • Сооружение. Можно заполнить до трёх полей. Это могут быть номер дома и корпуса, если они у вас есть в адресе.
  • Помещение в пределах квартиры. Это поле заполняется, если присутствует указание на помещение в пределах другого помещения в здании.

Не уверены, что укажете адрес по новым требованиям правильно? Наш онлайн сервис подготовит все документы для смены данных об ИП в ЕГРИП и сам правильно определит и внесет элементы адреса.

К примеру, адрес ИП: г. Москва, ул. Верхняя, дом 1, квартира 122. Тогда заполнить лист В формы Р24001 нужно так:

• Код субъекта: «77»;
• Муниципальное образование: вид — «3» (внутригородская территория города федерального значения), наименование — «МУНИЦИПАЛЬНЫЙ ОКРУГ БЕГОВОЙ»;
• Городское поселение и т.д.: не заполняем;
• Населённый пункт: не заполняем;
• Элемент планировочной структуры: пропускаем;
• Элемент улично-дорожной сети: тип — «УЛ.», наименование — «ВЕРХНЯЯ»;
• Здание/сооружение: тип — «Д. «, номер — «1»;
• Помещение в пределах здания, сооружения: тип — «КВ.», номер — «122»;
• Помещение в пределах квартиры: не заполняем.

Когда вносите вид адресного объекта, укажите не полное название, а сокращенное. Например, «город» — «г.», «улица» — «ул.», «квартира» — «кв». Список допустимых сокращений можно найти в Приказе Минфина РФ N 171н от 05.11.2015 г.

Читайте также: Нужно ли уведомлять налоговую о смене адреса ИП в 2022 году

5. Изменение ВНЖ или РВП — Лист Г

Лист Г предназначен для ИП-иностранцев и лиц без гражданства, которые получили новое разрешение о временном пребывании (РВП) или вид на жительство (ВНЖ).

Лист Г

Выберите код подходящего документа:

• «1» – вид на жительство,
• «2» – разрешение на временное проживание.

Затем заполните поля, вписав номер документа, дату, орган и срок выдачи. О ВНЖ теперь можно указать, что он выдан бессрочно.

6. Смена кодов ОКВЭД — Лист Д

Лист Д нужно подготовить всем индивидуальным предпринимателям (и гражданам РФ, и иностранцам, и лицам без гражданства), решившим сменить коды ОКВЭД. При этом на странице 1 листа Д вносят коды видов деятельности, которые ИП хочет добавить, а на странице 2 — коды ОКВЭД, которые надо исключить из ЕГРИП. Коды деятельности следует вписывать согласно справочнику ОКВЭД-2.

Лист Д. Страница 1

Лист Д. Страница 2

При смене основного кода ОКВЭД следует заполнить обе страницы. А при смене дополнительных кодов — только подходящую страницу. Так, если вы только добавляете код, заполните страницу 1, а если только удаляете — страницу 2.

Для дополнительных видов деятельности теперь предусмотрено 68 полей. Если этого недостаточно — подготовьте еще лист Д.

Подробнее: Изменение кодов ОКВЭД по форме Р24001

7. Информация о заявителе — Лист Е

Этот лист заполняют все заявители. На листе Е следует собственноручно написать свои ФИО и поставить подпись в присутствии сотрудника МФЦ, ИФНС или нотариуса. Если вы сменили ФИО, вы впишите свои новые фамилию, имя и отчество.

Лист Е

Укажите в листе актуальную личную и контактную информацию.

В пункте 2 укажите адрес электронной почты, на который ФНС пришлет документы. Теперь в этом пункте можно проставить цифру «1» в специальном поле, если заявитель желает получить документы и в бумажном виде. При наличии такой отметки, бумажный вариант готовых документов вы сможете получить в месте их подачи.

В пункте 3 напишите свой контактный номер.

Пункты 4 и 5 не заполняйте.

8. Общие требования к заполнению формы Р24001

Вам нужно учитывать следующие требования к оформлению заявления по форме № Р24001, чтобы избежать отказа ФНС:

• При заполнении формы вручную нужно использовать чернила черного, синего или фиолетового цвета, а все буквы и символы писать заглавными и печатными,
• При заполнении на ПК следует использовать шрифт Courier New, размер 18, заглавные буквы,
• Одна ячейка — один символ,
• Распечатывать, нумеровать и передавать в ФНС надо только те листы, которые касаются вашей ситуации,
• Все сведения из документов вносите в форму точь-в-точь,
• Не ставьте прочерки в незаполненных полях, оставьте эти графы пустыми,
• Разрешена двусторонняя печать заявления,
• При указании контактного телефона не нужно писать скобки, пробелы, прочерки. Но если вносите российский номер, он должен начинаться с +7, даже стационарный.

Подробнее: Внесение изменений в сведения об ИП

Сэкономьте время — направьте форму Р24001 в ФНС онлайн!

Не обязательно самостоятельно разбираться в правилах заполнения формы Р24001 — наш онлайн-сервис заполнит заявление за вас, учитывая все требования закона и ФНС к оформлению. Через наш сервис вы можете подать документы в налоговую онлайн, даже не выходя из дома — это быстро, надежно и удобно.

Подать Р24001 онлайн

Подать Р24001 онлайн

Форма Р24001 — внесение изменений в сведение об ИП, как заполнить и подать заявление онлайн

Страница 001 — причины подачи заявления

Лист 001 должны заполнить все ИП, которые по конкретным причинам подают в Федеральную налоговую службу форму Р24001. На первой странице указывают фамилию, имя и отчество предпринимателя, ИНН и ОГРНИП. 

При подаче заявления по причине смены ФИО, на первой странице нужно указать прежние данные, которые зарегистрированы в выписке ЕГРИП.

После личных данных нужно выбрать причину подачи, указав в пустой клетке цифру1 или 2, где:

• 1 — изменение сведений о предпринимателе.
• 2 — исправление ошибки в сведениях, предоставленных ранее.

Если указана вторая причина, то есть поставлен код 2, нужно дополнительно прописать номер записи ЕГРИП—ОГРНИП.

Образец заполнения 1 страницы 

Форма № Р24001 Страница 001 — причины подачи заявления (пример заполнения)

Лист А, Страница 002 — изменение ФИО

Лист А заполняют индивидуальные предприниматели без гражданства, а также иностранцы, сменившие ФИО или в ФИО которых допустили ошибку. Заполнять страницу нужно на русском языке латиницей.

При смене ФИО предприниматель должен получить новое удостоверение личности, а также новый документ о временном пребывании на территории Российский Федерации или новый вид на жительство.

В случае получения документов потребуется заполнить листы Г и Д, где нужно прописать их данные.

Образец заполнения 2 страницы, лист А

Форма № Р24001 Лист А, Страница 002 — изменение ФИО (пример заполнения)

Лист Б, страница 002 — изменение гражданства

Лист Б также заполняют предприниматели без гражданства и иностранцы, но на этот раз сменившие, утратившие или получившие гражданство. В том числе гражданство РФ.

Гражданский статус указывается в виде цифрового кода, где:

• 1 — гражданин России.
• 2 — иностранный гражданин.
• 3 — лицо без гражданства.

После статуса нужно прописать числовой код государства, в котором получено новое гражданство. Числовой код можно найти в Общероссийском классификаторе стран мира. 

Образец заполнения 2 страницы, лист Б

Форма № Р24001 Лист Б, страница 002 — изменение гражданства (пример заполнения)

Лист В, страница 002 — смена места пребывания в Российской Федерации

Лист В также следует заполнять иностранным гражданам и лицам без гражданства, но уже в случае смены российского адреса пребывания. Информация вносится на основании документа регистрации по новому адресу проживания. Если регистрационный документ не выдан, заполнять не нужно, так как можно допустить ошибку и форму Р24001 придётся подавать повторно.

В случае смены адреса дополнительно заполняется лист Д. На листе Д указывают реквизиты нового документа, разрешающего пребывание на территории России или реквизиты нового ВНЖ. 

Образец заполнения 2 страницы, лист В

Форма № Р24001 Лист В, страница 002 — смена места пребывания в Российской Федерации (пример заполнения)

Лист Г, страница 002 — смена удостоверения личности

Это ещё один лист, предназначенный для иностранцев. Лист нужно заполнить при смене удостоверения личности. Вносимые данные должны соответствовать указанным в оригинальном документе. 

На странице есть графа «код подразделения», но в оригинале документа её может не быть. В этом случае графу нужно оставить пустой. 

Образец заполнения 2 страницы, лист Г

Форма № Р24001 Лист Г, страница 002 — смена удостоверения личности

Лист Д, страница 002 — изменение документов о праве на временное пребывание или ВНЖ

Лист предназначен для заполнения иностранцами и лицами без гражданства в случае получения новых документов о ВНЖ или временном праве пребывания не территории России. На странице нужно указать реквизиты нового документа. 

Образец заполнения 2 страницы, лист Д

Форма № Р24001 Лист Д, страница 002 — изменение документов о праве на временное пребывание или ВНЖ (пример заполнения)

Лист Е, страница 002 и 003 — изменение видов деятельности

Лист нужно заполнять предпринимателям, которые меняют вид деятельности. Лист включает две страницы. На первой странице предприниматель указывает новые коды ОКВЭД, а на второй коды ОКВЭД, которые нужно удалить.

Если смене подлежит основной вид деятельности, следует заполнить обе страницы. При этом на первой странице в строке 1.1 необходимо указать новый вид деятельности, а на второй странице в строке 2.1 старый. 

Если необходимо оставить старый основной вид деятельности в качестве дополнительного, его следует указать в строке 2.1 на второй странице, а также в строке 1.2 на первой странице.

Если нужно добавить только дополнительный вид деятельности, укажите его на первой странице. Вторую страницу в этом случае можно оставить незаполненной. 

Образец заполнения 2 страницы, лист Е

Форма № Р24001 Лист Е, страница 002 и 003 — изменение видов деятельности (пример заполнения)

Образец заполнения 3 страницы, лист Е

Образец заполнения 3 страницы, лист Е

Лист Ж, страница 003 — подпись и заверение данных

Лист следует заполнять всем предпринимателям, которые подают заявление. Указать необходимо ФИО, а также поставить личную подпись. 

Указывать ФИО и ставить подпись ИП может только в присутствии нотариуса, сотрудника МФЦ или налоговой.

В случае подачи заявления через представителя или отправки почтой, подпись необходимо нотариально заверить. Если заявление подаёт представитель, у него должна быть нотариальная доверенность.

Образец заполнения 3 страницы, лист Ж

Форма № Р24001 Лист Ж, страница 003 — подпись и заверение данных (пример заполнения)

Общие требования для заполнения формы Р24001 по состоянию на 2020 год

Заявление следует заполнять от руки чёрными чернилами заглавными печатными буквами или же набрать шрифтом Courier New 18 размером. Каждую букву, цифру или символ следует прописывать в отдельной строке. Заполнять необходимо только те листы, страницы и строки, которые касаются вашей ситуации. Распечатывать и подавать пустые листы не нужно. Двусторонняя печать недопустима, печатать можно только с одной стороны.

Как можно подать заявление об изменении сведений индивидуального предпринимателя

Документы разрешено подавать четырьмя способами:

• Лично в МФЦ или ИФНС. Для подачи необходим паспорт и пакет документов.
• Через представителя. Кроме пакета документов представитель должен предоставить нотариальную доверенность. Доверенность можно оформить на сдачу и получение документов.
• По почте. Для отправки понадобится нотариально заверить заявление, а также приложить копию паспорта. Документы следует вложить в конверт, сделать опись вложения и отправить в виде письма с объявленной ценностью.
• Отправить в электронном виде через программу Почтовый Агент. 

Когда изменения будут зарегестрированны в ЕГРИП

Налоговая служба обязуется в течение 5 рабочих дней передать заявителю лист ЕГРИП с внесёнными изменениями или отправить мотивированный отказ во внесений изменений в существующие данные. Если вы должны получить ответ от ФНС по почте, срок получения документов может увеличиться в соответствии с условиями доставки. 

В случае, когда заявитель не приходит в назначенный день забрать документы, ИФНС отправляет их почтой. Аналогичным образом налоговая служба поступает, если в заявлении не указан способ получения документов. Если вы подаёте документы через МФЦ, ответ также будет направлен туда.

Что делать в случае отказа в регистрации изменений

ИФНС может отказать во внесении изменений по таким причинам:

• ИП предоставил неполный пакет документов;
• подача заявления сделана в ненадлежащий орган регистрации;
• нет нотариального заверения в случаях, когда его необходимо предоставить;
• заявление подписано неуполномоченным лицом;
• до подачи заявления в ЕГРИП или ИФНС получен акт судебного пристава на запрет о внесении изменений.

Отказ подлежит обжалованию в течение трёх месяцев с момента получения.  

Как отправить заявление об изменении сведений ИП (форма Р24001)

Откройте программу отправки электронной отчетности «Почтовый агент».

Перейдите на вкладку «Реестр документов» и нажмите кнопку «Добавить» (в левом верхнем углу).

Откроется окно с ранее добавленными шаблонами. Нажмите кнопку «Обновить шаблоны с сервера».

Откроется список шаблонов.

Нажмите Ctrl F и в поисковой строке введите номер документа: 1112502. Отметьте галочкой найденный шаблон и нажмите кнопку «Обновить шаблоны».

 Теперь шаблон нужного документа появится в вашем реестре документов.

Выберите данный шаблон, нажав кнопку «Выбрать» и откройте его. Заполните заявление (будьте внимательны, документ многостраничный).

Обратите внимание:

Сведения об ИП заполняются в соответствии со сведениями ЕГРИП. Если заявление подается в связи с исправлением ошибок, допущенных в ранее представленном заявлении, то указывается государственный регистрационный номер записи, внесение которой было осуществлено на основании заявления, содержащего ошибки.

Лист А заполняется в случае изменения (исправления) ФИО, сведений о рождении ИП – иностранного гражданина или лица без гражданства.

Лист Б заполняется при изменении гражданства гражданином РФ или иностранным гражданином, приобретении гражданства лицом без гражданства.

Лист В предназначен для физических лиц, не имеющих места жительства на территории РФ.

Листы Г и Д предназначены для иностранных граждан и лиц без гражданства.

В Листе Е отражаются коды по ОКВЭД, подлежащие внесению в ЕГРИП (не менее четырех цифр) либо исключению из ЕГРИП.

В Лист Ж вносятся сведения о заявителе.

Помимо заявления, в регистрирующий орган представляются документы, подтверждающие внесение изменений в ЕГРИП.

По окончании заполнения заявления нажмите кнопку «Сохранить».

Нажмите в окне шаблона кнопку «Печать».

Откроется страница документа. Нажмите кнопку «Сохранить». При выборе формата для сохранения выберите «pdf».

В следующем окне нажмите кнопку «Ок».

Вам будет предложено сохранить документа на вашем компьютере в виде файла в формате pdf. Назовите файл и нажмите «Сохранить».

Далее в программе «Почтовый агент» перейдите в раздел «Отчетность» – «Документооборот с ФНС» – «Новый отчет».

В окне отправки укажите в поле «Кому» ваше отделение ФНС, также укажите код налоговой.

Нажмите кнопку «Вложить файл» и прикрепите файл с заявлением. После этого нажмите кнопку «Отправить».

Возможно вам будет интересно:

Как закрыть ИП?

Низкий уровень цепи управления насосом обнаружения утечки EVAP

Определение кода неисправности P2401

P2401 — это общий код неисправности OBD2, указывающий на неисправность в цепи обнаружения утечки EVAP. Этот код можно увидеть с другими системными кодами EVAP.

Что означает код P2401

Код неисправности P2401 говорит нам, что в цепи управления EVAP возникла неисправность с насосом обнаружения утечек. Насос обнаружения утечек используется ECM для создания давления в системе EVAP для проверки наличия утечек.

Когда модуль ECM обнаружит низкое напряжение в цепи, он выдаст код P2401. Код будет оставаться до тех пор, пока проблема не будет решена или не будет обнаружено нормальное напряжение во время нескольких поездок автомобиля.

Что вызывает код P2401?

• Газовая крышка неисправна
• Неисправность угольного бачка
• Утечки или трещины в трубопроводах паров топлива
• Обрыв или короткое замыкание в жгуте проводов
• ECM, который вышел из строя или дает сбой
• Неисправность соленоида управления продувкой
• Насос обнаружения утечек вышел из строя

Каковы симптомы кода P2401?

Как механик диагностирует код P2401?

Код P2401 может быть сложным для диагностики. Следуя этим простым шагам, технические специалисты могут диагностировать этот код:

• Подключите сканер и проверьте наличие кодов, хранящихся в ECM

• Запишите все коды и данные стоп-кадра для каждого

• Удалить все коды

• Возьмите автомобиль на тест-драйв, желательно в тех же условиях эксплуатации, что и данные стоп-кадра

• Выполните визуальный осмотр системы EVAP на наличие сломанных или треснутых компонентов и линий

• Проверка газовой крышки с помощью тестера крышки

• С помощью диагностического прибора будет выполнена самопроверка системы EVAP

• Дымовая машина будет использоваться для проверки утечек и утечек EVAP

• Наконец, ECM будет протестирован, если ничто другое не даст окончательного ответа

Распространенные ошибки при диагностике кода P2401

• Код P2401 может быть сложным для диагностики, так как существует множество различных компонентов, которые могут вызывать его.

• Обычно заменяется газовая крышка и код сбрасывается. Это может решить некоторые проблемы с P2401, но не все. В тех случаях, когда код появляется снова, потребуется пошаговое диагностическое тестирование для точной диагностики этого кода.

Насколько серьезен код P2401?

P2401 не проявляет никаких проблем, которые мешают нормальному вождению автомобиля. Однако это не позволит автомобилю пройти испытания на выбросы и может привести к выбросу паров топлива в атмосферу.

Какой ремонт может исправить код P2401?

• Газовая крышка проверена и заменена
• Канистра с активированным углем заменена на
• Утечки или трещины в трубопроводах паров топлива заменены
• Ремонт или замена жгута проводов
• ECM заменяется по мере необходимости
• Неисправный соленоид управления продувкой заменен
• Насос обнаружения утечек заменен

Когда в системе EVAP есть утечки, это обычно утечки паров. Эти утечки обычно слишком малы, чтобы их можно было увидеть без посторонней помощи, и их можно заметить только по индикатору Check Engine или по запаху топлива. Когда это происходит, дымовая машина используется для заполнения системы EVAP дымом определенного типа, который делает утечки видимыми, чтобы их можно было отремонтировать.

Нужна помощь с кодом P2401?

YourMechanic предлагает сертифицированных мобильных механиков, которые приедут к вам домой или в офис для диагностики и ремонта вашего автомобиля. Получите предложение и запишитесь на прием онлайн или поговорите с консультантом по обслуживанию по телефону 1-800-701-6230.

Индикатор проверки двигателя

коды неисправностей

P2401

Залов ожидания больше нет! Наши механики приедут к вам для диагностики и исправления кода P2401.

РАСПИСАНИЕ P2401 ДИАГНОСТИКА

Получите кредит в размере 50 долларов США на последующий ремонт

База данных jPOST

Срез 1:

Срез 2:

Что такое «jPOSTdb»?

• База данных jPOSTdb содержит результаты повторного анализа с унифицированными критериями для необработанных данных из jPOSTrepo и других репозиториев ProteomeXchange (PX).
• Обеспечивает следующие функции:
• • Фильтрация набора данных по метаданным
  • Просмотр идентифицированных пептидов, посттрансляционных модификаций (PTM) и других данных
  • Создание и сравнение «Slice», который представляет собой набор(ы) данных, отфильтрованных пользователем
  • Базовый статистический анализ и визуализация заданного «Среза»;
• jPOSTdb хранит информацию о совпадении спектра пептидов (PSM) и информацию об идентифицированных пептидах для каждого набора данных.
• Белки выведены на основании этой информации по методу, предложенному Несвижским, А.И. и другие. 2005 г. (дои: 10.1074/mcp.R500012-MCP200)
• База данных jPOST использовала набор данных UniProt Reference Proteome (с дополнительным файлом .fasta) для идентификации пептидов.
• Такая информация, как наборы данных, предполагаемые белки, идентифицированные пептиды и PSM, иерархически хранится в базе данных jPOST. Все объединение наборов данных называется «Globe», а извлеченные частичные наборы данных, отфильтрованные из Globe, называются «Slice».

Как использовать jPOSTdb

• Фильтрация «Глобус»
• • Кураторские метаданные, такие как виды, типы образцов и клеточные линии, предоставляются для фильтрации Globe, объединения всего набора данных, а также для простого поиска по ключевым словам.
  • Круговые диаграммы справа можно использовать для указания метаданных о видах и заболеваниях, просто щелкнув цель.
• Как сделать «Срез»
• • Нажмите кнопку «Новый фрагмент» на вкладке «Поиск» или кнопку «+» на вкладке «Фрагмент».
  • Установите флажки для интересующего вас набора данных.
  • Нажмите кнопку «Создать».
  • Поскольку данные Slice хранятся в WebStorage вашего браузера, ваши данные никогда не утекают в Интернет. Другой браузер на вашем компьютере не использует WebStorage. Итак, вам нужно экспортировать и импортировать срез, чтобы просматривать одни и те же наборы данных в другом месте (в другом браузере).
• Сравнение срезов
• • Два выбранных среза можно сравнить для статистического и функционального анализа.
  • Подробности описаны ниже.

Информационные страницы для набора данных, среза и белка

• Страницы набора данных и среза состоят из «Информации о хромосоме», «Существования белка» и «Картирования пути KEGG», тогда как страницы белка состоят из «Браузера белков» и «Обмен пептидами».

Хромосомная информация.

• Гистограмма обнаруженных ведущих белков (синий) и общего количества белков (серый) на хромосому, митохондрии и плазмиду. Количество белков основано на количестве записей UniProt (поэтому общее количество белков не означает точное количество кодирующих генов в каждой хромосоме). В наборе данных человека количество белков основано на количестве записей neXtProt.

Существование белков

• Круговая диаграмма типов доказательств, подтверждающих существование белков, описанных в базе данных neXtProt (для человека) и базе данных UniProt (для других).
• • (ссылка uniprot:protein_existence)
• Белки, классифицированные как каждый тип доказательств, перечислены с помощью раскрывающегося меню или интерактивной легенды/диаграммы.

Схема пути KEGG

• Белки с аннотацией KEGG Orthology (KO) могут быть сопоставлены с путем KEGG. Цвет белковых блоков на картах путей варьируется от красного до синего (красный и синий показывают высокую и низкую экспрессию, соответственно, на основе их спектральных подсчетов).

Protein Browser

• Protein Browser — программа для просмотра аннотаций белков. Пользователи могут добавлять интересующие аннотации на панель просмотра из выпадающего меню.
• • «Выравнивание пептидов» показывает сопоставление обнаруженных пептидов с последовательностью белка. Цвет столбцов пептидов отражает количество PSM и варьируется от красного до серого (красный показывает высокий уровень, а серый — низкий).
  • «Сайт PTM» показывает обнаруженные PTM в последовательности белка. Длина вертикальной полосы над сайтом отражает количество обнаружений PTM. ‘ норма.’ показывает нормализованную длину по спектральным подсчетам, включая сайт, а «подсчет» показывает реальные подсчеты.
  • «Связь P-сайта» показывает совпадение сайтов фосфорилирования на пептиде.
  • «Аннотация UniProt» показывает сайты PTM и варианты отдельных аминокислот, описанные в UniProt.
• • Увеличение/уменьшение масштаба с помощью колеса прокрутки/сенсорной панели
  • горизонтальное перемещение с перетаскиванием

Совместное использование пептидов

• Совместное использование пептидов показывает сопоставление общих пептидов с несколькими белками. Один и тот же цвет полосок пептидов означает одинаковые пептиды. Числовые значения над столбиком пептидов представляют собой количество PSM. Пользователи могут переключать отображение с помощью шести кнопок под выравниваниями.
• • имя: переключение видимых/невидимых имен белков
  • цвет: переключение цвета: i) Пептиды, сопоставленные только с эталонным белком (верхний белок), окрашены, а остальные пептиды окрашены в серый цвет. ii) Все пептиды окрашены.
  • трипсин: показать сайт расщепления трипсином на белковых последовательностях. Нетриптические пептиды окрашены в серый цвет.
  Экзон
  • : показать границу экзонов на белковых последовательностях
  . Направляющая
  • : показать направляющую линию
  • редактировать: удалить белок пользователю не нужно
• • Увеличение/уменьшение масштаба с помощью колеса прокрутки/сенсорной панели
  • горизонтальное перемещение с перетаскиванием

Сравнение фрагментов

• Пользователи могут сравнивать два фрагмента, выбрав Фрагменты из раскрывающегося меню.

Дифференциальный анализ экспрессии

• Пользователь может сравнить уровень экспрессии белков между двумя срезами с помощью эмпирической оценки Байеса, критерия суммы рангов Уилкоксона и кратного изменения среднего из раскрывающегося меню. Количественная оценка основана на спектральном подсчете.
• Первые два метода используют библиотеку языка программирования R. Для этих методов требуется как минимум 2 набора данных в каждом срезе. На графике вулкана пользователи могут изменять пороги изменения кратности и значения p, перемещая треугольный маркер по осям x и y.
• Кратность изменения среднего уровня экспрессии в белке показана в виде гистограммы. Какой-либо статистический тест не применяется, поэтому p-значение не рассчитывается. Ось Y показывает псевдочастоту и не имеет строгого значения.
• • переместить пороговые полосы с перетаскиванием треугольных маркеров

Анализ обогащения

• Анализ обогащения набора белков для выбранных белков в анализе дифференциальной экспрессии. Пользователи могут выбрать цель из категории путей KEGG и трех категорий онтологии генов (GO) (биологический процесс, молекулярная функция и клеточный компонент).
• Результат отображается в виде сетевого графика и таблицы. Узлы в сети показывают категории KEGG или GO, а цвет узла расширенной категории варьируется от желтого до красного (значение p <0,05, желтый показывает высокий уровень, а красный — низкий уровень). Синий узел показывает корневую категорию сети. Размер каждого узла отражает количество выбранных белков в анализе дифференциальной экспрессии. Однако размер белого узла и корневого узла ограничен максимальным размером расширенных узлов, окрашенных от желтого до красного, чтобы сделать схему сети более четкой.
• • Увеличение/уменьшение масштаба с помощью колеса прокрутки/сенсорной панели
  • двигаться с перетаскиванием
• Когда целью является путь KEGG, пользователи могут сопоставлять белки с картой пути KEGG. Ящики карт окрашены от синего до красного (синий цвет показывает снижение уровня экспрессии, а красный — увеличение). Когда блок соответствует нескольким белкам, цвет блока отражает любой из белков (это ограничение картографа KEGG).

Словари

• База данных
• • Земной шар: Накопленные результаты повторного анализа необработанных данных. Все наборы данных в jPOSTdb.
  • Срез: группа наборов данных, которая является результатом фильтрации метаданных из базы данных земного шара. Или группу наборов данных, которая объединила несколько результатов фильтрации.
• Тип белка
• • Ведущий белок: Репрезентативный белок в группе белков. (ссылка PSI-MS_1002401)
  • Белок с таким же спектром: Белок, который соответствует тому же набору спектра (тот же набор PSM) ведущего белка. (ссылка PSI-MS_1001595)
  • Белок подмножества спектра: Белок, который соответствует спектру подмножества ведущего белка. (ссылка PSI-MS_1001597)
  • Подлежащий спектру белок: Белок, спектр которого приходится на два или более ведущих белка. (ссылка PSI-MS_1001599)
• Пептид типа
• • Общий пептид: пептид существует во множестве белков. Понятно, что это не уникальный пептид.
  • Уникальный пептид: пептид существует только в одном белке.
  • • Общий пептид на уровне МС: пептид существует в нескольких белках, когда лейцин и изолейцин не различаются. Это уникальный пептид на уровне аминокислот, но не уникальный по результатам МС.
    • Уникальный пептид на уровне MS: пептид существует только в одном белке, даже если лейцин и изолейцин не различаются. Это уникальный пептид, однозначно.

Справочный номер

• Среда jPOST: интегрированный репозиторий и база данных протеомных данных
  Юки Мория, Шин Кавано, Судзиро Окуда, Ю Ватанабэ, Масаки Мацумото, Томойо Таками, Дайки Кобаяси, Ёсинори Яманучи, Нори Араки, Акиясу С.